Zarpando desde Puerto Montt, se dirige hacia el sur pasando por Puerto Chacabuco, punto neurálgico de la Carretera Austral, importante y única vía que une por el continente Puerto Montt con el sur. Ubicada a los pies de Campos de Hielo Norte, la Laguna San Rafael tiene como telón de fondo la imponente pared del glaciar que lleva su nombre: el Glaciar San Rafael.